Em 2003, a partir de uma investigação da Procuradoria Regional da República da 3ª Região, a Polícia Federal deflagrou a Operação Anaconda, que desmantelou um esquema de corrupção que envolvia integrantes da polícia federal, do poder judiciário e advogados.

A organização criminosa tinha base em São Paulo e ramificações nos estados de Alagoas, Pará e Rio Grande do Sul. As transações envolviam vendas de sentenças e de informações judiciais e policiais para favorecer criminosos que eram clientes de advogados envolvidos no esquema.

Na época, 12 pessoas foram denunciadas: três juízes federais, alguns delegados da PF, policiais federais, advogados e um empresário. Nove dos denunciados foram presos, entre eles o ex-juiz federal João Carlos da Rocha Mattos, apontado como um dos líderes da organização.

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