Após o golpe ocorrido em 1964, quando junta militar depôs o presidente eleito João Goulart¹, o Ministério Público Federal voltou a atuar perante a Justiça Federal, que foi reinstituída. Naquele novo período ditatorial, as liberdades individuais eram limitadas e as prerrogativas e garantias do Ministério Público restritas. Havia também todo um movimento para enquadrar o Judiciário e combater o comunismo e as pessoas consideradas “subversivas” pelo Governo.

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1 Depois da instauração de um regime socialista em Cuba em 1953, a poucos quilômetros de seu território, os EUA decidiram apoiar em toda a América Latina regimes militares de extrema direita para combater à chamada “ameaça comunista”.
Logo após a Segunda Guerra Mundial, o mundo esteve dividido entre dois grandes polos de poder que se rivalizavam. De um lado os países capitalistas liderados pelos Estados Unidos e de outro os países socialistas liderados pela União Soviética.